• Manhunt (Chasse à l'homme) » Épisode 2.01 - Première diffusion US le 21/08/06

Bien que huit heures soient déjà passées depuis l'évasion, Michael, Lincoln, Sucre, C-Note et Abruzzi essayent toujours de semer la police…
Bellick continue ses recherches mais n'apprécie pas qu'Alexander Mahone essaye de prendre les commandes. Pourtant, l'intelligence et la réflexion de l'agent fédéral rendent la vie de Michael en tant que fugitif assez dangereuse…
Après avoir fait une overdose, le docteur Tancredi est dans un état critique tandis que T-Bag doit trouver une solution pour s'en sortir…
Toujours dans le Montana, Veronica devient la prisonnière de Terrence Steadman…

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• Otis » Épisode 2.02 - Première diffusion US le 28/08/06

Michael et Lincoln prévoient une autre évasion mais cette fois-ci pour LJ, toujours interrogé par Mahone qui le questionne pour tenter d'apprendre où son père et son oncle se cachent…
A Fox River, Bellick et Pope sont face à un jury et subissent les conséquences de l'évasion…
A Saint-Louis, Tweener cherche un moyen d'aller dans l'Utah tandis que T-Bag récupère enfin sa main et décide de se débarasser du vétérinaire…

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• Scan » Épisode 2.03 - Première diffusion US le 04/09/06

Mahone poursuit toujours Michael et Lincoln jusqu'à ce que la voiture de ces derniers ait quelques petits ennuis…
Plus loin, Sucre apprend que Maricruz compte épouser Hector alors que C-Note contacte sa femme et sa fille, toujours sous surveillance…
De son côté, Sara est arrêtée par la police et reçoit la visite de son père. Celui-ci la force d'ailleurs a retourner faire une thérapie… Là-bas, quelqu'un garde un oeil sur elle…

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• First Down » Épisode 2.04 - Première diffusion US le 11/09/06

Bellick et Geary se lancent à la poursuite de Michael, Lincoln et Nika. En effet, les deux anciens gardiens espèrent qu'ils les conduiront tout droit à l'argent de Westmoreland…
Toujours en vadrouille, T-Bag fait la connaissance d'un père de famille et de sa petite fille alors que, bien qu'il soit de retour auprès de sa femme, Abruzzi pense encore à se venger de Fibonnaci…
En ville, Kellerman et Sara se rapprochent jusqu’à ce que cette dernière reçoive enfin le coup de téléphone qu'elle attendait depuis dès jours…
Pour finir, l'agent Alexander Mahone s'apprête à capturer un des fugitifs…

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• Map 1213 » Épisode 2.05 - Première diffusion US le 18/09/06

Mahone s'intéresse soudainement à l'argent du mythique DB Cooper mais semble de plus en plus nerveux…
Parallèlement, Michael et Lincoln sont plus que jamais déterminés à trouver les premiers l'argent enterré dans l'Utah. Cependant, d'autres fugitifs espèrent exactement la même chose…
Enfin à Las Vegas, Sucre doit voir Maricruz avant la cérémonie mais c’est une toute autre personne qui se présente à lui…
En ville, l'agent Paul Kellerman surveille toujours Sara. Cette dernière décide d'ailleurs de l'inviter chez elle…

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• Subdivision » Épisode 2.06 - Première diffusion US le 25/09/06

Dans l'Utah, Michael, Lincoln et T-Bag cherchent toujours l'endroit exact où Westmoreland a enterré l'argent. Lorsqu’ils trouvent enfin la maison, ils élaborent un plan pour y entrer sans être reconnus par Jeanette, la propriétaire…
Alors que Haywire fait son grand retour, Sucre rencontre par hasard une autre vieille connaissance…
Au FBI, Mahone s'intéresse de plus en plus à la légende de DB Cooper ce qui le conduit tout droit vers les fugitifs…

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• Buried » Épisode 2.07 - Première diffusion US le 02/10/06

Lincoln ne pense plus qu'à libérer LJ, emprisonné en Arizona, pendant que Michael, C-Note, Sucre et T-Bag finissent enfin par déterrer le trésor…
A Chicago, Kellerman change d'attitude vis à vis de Sara alors qu’elle devient la principale cible de la Compagnie…
Au FBI, Mahone force Tweener à coopérer…

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• Dead Fall » Épisode 2.08 - Première diffusion US le 23/10/06

Michael, C-Note et T-Bag n’en reviennent toujours pas: Sucre les a trahis et s’est enfui avec les 5 millions…
Au FBI, Mahone doit maintenant expliquer la mort de Tweener à Richard Sullins, une vieille connaissance des Affaires Internes…
Arrivé dans l'Arizona, Lincoln élabore un plan pour récupérer LJ tout en évitant de se faire prendre par la Compagnie…
En ville, Sara doit maintenant faire très attention: ses ennemis sont partout…

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• Unearthed » Épisode 2.09 - Première diffusion US le 30/10/06

Pendant que Lincoln et LJ ont un voyage semé d’embûches, Michael se rapproche de l’épouse de l’agent Mahone en espérant en découvrir plus sur lui…
T-Bag retourne lui chercher une ancienne conquête tandis que la femme de C-Note doit choisir entre son mari et sa petite fille…

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• Rendezvous » Épisode 2.10 - Première diffusion US le 06/11/06

Le rendez-vous de Michael avec Sara est tout sauf romantique. En effet, l'agent Mahone est à leurs trousses…
Lincoln et LJ reçoivent eux l’aide inattendue d’un autre membre de la famille alors que Bellick compte faire craquer T-Bag…

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• Bolshoi Booze » Épisode 2.11 - Première diffusion US le 13/11/06

Alors qu'il est sur le point de rejoindre Michael, Lincoln est obligé de se séparer d'un autre être qui lui est cher… De son côté, le jeune frère est opposé à quelqu'un de très astucieux qui chamboule encore ses plans…
En ville, T-Bag a été obligé de faire un choix crucial tandis que Kellerman s'en prend à Sara…

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• Disconnect » Épisode 2.12 - Première diffusion US le 20/11/06

La réunion de famille rappelle à Michael de mauvais souvenirs de son enfance tandis que Mahone conclut un pacte avec Coyote…
C-Note et Kacee prennent eux de gros risques en allant en ville pendant que Bellick et Kellerman doivent chacun affronter une situation délicate…

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• The Killing Box » Épisode 2.13 - Première diffusion US le 27/11/06

Dans un bar, T-Bag fait la connaissance de Denise et se sert d'elle pour trouver la nouvelle adresse de Susan Hollander, celle qui l'a dénoncé…
Kellerman et Mahone font quant à eux tout ce qui est en leur pouvoir pour empêcher Michael et Lincoln de s'en sortir vivants. Ils préfèrent en effet les voir à la morgue que dans leurs anciennes cellules…
D'ailleurs, de retour à Fox River, Bellick apprend qu'il ne bénéficiera d'aucun traitement de faveur…

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• John Doe » Épisode 2.14 - Première diffusion US le 22/01/07

Michael et Lincoln sont de nouveaux sur les routes en compagnie de l'agent Kellerman qui semble avoir changé de camp…
Alors que C-Note est désormais seul avec sa petite fille, Mahone gère une nouvelle crise pendant que T-Bag oblige Susan Hollander et ses enfants à jouer avec lui à la parfaite petite famille…
A Fox River, Bellick essaye de faire ses preuves mais devient vite une proie facile pour les autres détenus…

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• The Message » Épisode 2.15 - Première diffusion US le 29/01/07

Michael, Lincoln et Kellerman tentent d'échapper aux autorités et kidnappent un journaliste. Une fois à l'abris, ils enregistrent un message vidéo dans lequel ils dénoncent la conspiration. C'est également pour eux l'occasion de contacter Sara, dont ils n'ont aucune nouvelle…
Tandis que Haywire sympathise avec deux adolescents, Sucre reçoit l'aide d'un bon samaritain…

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• Chicago » Épisode 2.16 - Première diffusion US le 05/02/07

En route pour Chicago, Michael et Sara cèdent à la tentation et se dévoilent leurs sentiments… Cependant, ils gardent un oeil sur Kellerman.
De son côté, Mahone trouve un nouvel allié pour capturer les fugitifs. Un des évadés est d'ailleurs bientôt pris au piège…

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• Bad Blood » Épisode 2.17 - Première diffusion US le 19/02/07

Après avoir réalisé que l'ancien directeur de Fox River, Henry Pope, est suceptible de les aider dans leur quête d'informations pour faire tomber la Compagnie, Michael et Sara lui demandent de l'aide…
Pendant que Sucre met tout en oeuvre pour rejoindre Maricruz, C-Note prend des risques pour sauver la vie de sa fille…
Quant à T-Bag et Mahone, le premier revisite sa maison d'enfance avec les Hollander alors que le second coince un nouvel évadé…

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• Wash » Épisode 2.18 - Première diffusion US le 26/02/07

Désormais en possesion d’un message audio compromettant, les deux frères et Sara essayent d'entrer en contact avec un autre ennemi de la Compagnie qui les aiderait à faire éclater la vérité…
Parallèlement, Mahone confit une nouvelle mission à Bellick et fait chanter C-Note... Kellerman projette quant à lui de s'en prendre à la Présidente…
De son côté, T-Bag se rend dans un cabinet psychiatrique et sa séance se révèle plus que thérapeutique…

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• Sweet Caroline » Épisode 2.19 - Première diffusion US le 05/03/07

Pendant que Kellerman se prépare pour un assassinat, Michael est déterminé à rencontrer la Présidente et à faire éclater la vérité grâce à la cassette audio dans laquelle elle dévoile tous ses secrets…
Au même moment, Mahone joue à un jeu dangereux avec Sara tandis que T-Bag rencontre quelques problèmes pour récupérer son sac, ce qui pourrait être très profitable à Sucre et Bellick…

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• Panama » Épisode 2.20 - Première diffusion US le 19/03/07

Par amour, Sara se sacrifie pour que Michael et Lincoln retrouvent enfin la liberté et soient en sécurité… Cependant, la situation entre les deux frères s’envenime rapidement…
Au Mexique, T-Bag continue lui de faire régner la terreur alors que Bellick force Sucre à l'aider à retrouver les millions perdus…
Enfin, Mahone est quant à lui finalement rattrapé par son passé, notamment grâce au témoignage de C-Note…

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• Fin Del Camino » Épisode 2.21 - Première diffusion US le 26/03/07

Alors que Michael veut à tout prix arrêter T-Bag, Bellick cherche lui à mettre la main sur les millions de Westmoreland…
De leurs côtés, Mahone et Lincoln règlent leurs comptes tandis que Sara rencontre une nouvelle fois quelques problèmes…
Kellerman choisit quant à lui sa propre fin du jeu…

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• Sona » Épisode 2.22 - Première diffusion US le 02/04/07

Le temps jouant contre lui, Michael essaye tant bien que mal de secourir Lincoln et de battre Mahone à son propre jeu…
Au même moment, Sucre risque sa vie pour sauver Maricruz tandis que Kellerman témoigne au procès de Sara…

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